Modelisation numérique

Cherchez-vous des moyens de simuler vos données ou de modéliser un processus en particulier? Voulez-vous résoudre un ensemble d’équations différentielles ou accélérer votre algorithme?

Parmi les nombreux types de services de conseil scientifique que nous fournissons chez XpertScientific, nous développons également des modèles numériques, effectuons des simulations et pouvons vous aider à trouver une solution efficace à vos problèmes scientifiques. Les scientifiques de XpertScientific ont une expérience combinée de modélisation de plus de 150 ans et nos domaines d'expertise comprennent la biologie, la bio-informatique, l'écologie, l'océanographie, la physique, etc.

Des projets récents

Les projets récents de modélisation auxquels nous avons participé incluent :

• Simulations de Monte Carlo et Marche Aléatoire (Random Walks) en biologie
• Traçage de rayons optiques à travers des gouttes de pluie tombant librement
• Modélisation de la photosynthèse (y compris la photoacclimation et l'inhibition) dans le phytoplancton
• Modélisation de l'océan: 3D à une résolution de 1/4 degré, en utilisant une bathymétrie réaliste et forçage externe /assimilation des données
• Modèles de suivi des particules, à la fois en 1D et en 3D
• Modélisation de turbulence
• Modélisation de l'infectivité parasitaire
• Identification de gènes évoluant rapidement qui sont impliqués dans la pathogénicité fongique, la spécialisation de l'hôte et potentiellement dans la spéciation
• Développement de Phylo-MCOA: une méthode basée sur l'analyse de co-inertie multiple pour l'identification de gènes et d’espèces anomales (outliers) dans des études phylogénomiques
• Optimisation / algorithmes de minimisation des problèmes (moindres carrés, inversion)

Diffraction de Fraunhofer à une ouverture circulaire

Amplitude du champ électrique au niveau du détecteur créé par la diffraction de Fraunhofer au niveau d'une ouverture circulaire.

Traçage de rayons optiques

Traçage de rayons optiques à travers des gouttes de pluie tombant librement. Le panneau supérieur montre la trace d'un rayon à travers une goutte de 3mm avec le rayon entrant de la gauche, les normales de surface aux points d'entrée et de sortie (jaune), et les rayons réfléchis (a) et doublement réfractés vers l'avant (b). Le panneau inférieur montre la différence entre les intensités de lumière polarisées "y" et "z", des rayons qui ont été réfractés dans l'hémisphère avant pour une taille de goutte de 3 mm, basée sur le méthode de Monte-Carlo de Ross et Bradley (2002).

Modélisation de la perte d'ordre génétique

Modélisation de la perte d’ordre génétique (gene order loss, GOL) à partir de l’information phylogénétique des gènes mitochondriaux dans un grand groupe de champignons. L’ordre des gènes dans chaque espèce est représenté par une chaîne de cases colorées. Le GOL peut être modélisé, en fonction des distances entre espèces (données par longueurs de branches), mais aussi en utilisant la topologie de l’arbre.

Analyse multivariée

Une approche graphique multivariée pour détecter des espèces concordantes et discordantes (aberrantes) dans une topologie. Nous calculons les distances par paires entre les espèces de l'arbre, effectuons une analyse en composantes principales et projetons les axes de séparation sur un seul plan pour une visualisation rapide.

Langages de programmation

Nous utilisons les langages de programmation suivants.

• C/C++
• Fortran
• Matlab
• Python
• R

Notre infrastructure informatique et nos listes de prix informatiques se trouvent sur notre page du cluster de calcul.

Certains de nos clients